在主會場報告中，貝瑞基因董事長高揚博士通過題為《出生缺陷基因防控技術(shù)新進(jìn)展—— 一管血和一管羊水的價值》的報告，回顧了近年來貝瑞基因以高通量測序技術(shù)的臨床轉(zhuǎn)化為背景，攜手眾多醫(yī)療機(jī)構(gòu)，一同揭示遺傳病發(fā)病機(jī)制的研究歷程，以“最大限度地消除人類致病基因”為使命，深度解析一管血和一管羊水在出生缺陷防控中的臨床檢測新價值。

首先，高揚博士介紹到，貝瑞基因自成立以來，憑借自主研發(fā)的核心技術(shù)，先后開發(fā)了基于高通量測序的貝比安無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測技術(shù)、科諾安染色體疾病檢測技術(shù)、科孕安胚胎植入前遺傳學(xué)篩查技術(shù)以及昂科益腫瘤分子診斷技術(shù)，覆蓋人類全生命周期的基因檢測，如胚胎早期染色體異常檢測的PGS、產(chǎn)前檢測的NIPT、NIPT-Plus、CNV-Seq、單基因遺傳病診斷的全外顯子組測序以及腫瘤相關(guān)的基因檢測產(chǎn)品，真正實現(xiàn)了高通量測序技術(shù)在我國臨床應(yīng)用的產(chǎn)品化進(jìn)程，現(xiàn)已與國內(nèi)30多個省市自治區(qū)超過2000家醫(yī)院形成共建實驗室。

多年來，貝瑞基因鎖定出生缺陷二級防控的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測領(lǐng)域，與湖南省家輝遺傳?？漆t(yī)院先后完成了NIPT、NIPT-Plus、NIPT-SGD等技術(shù)的聯(lián)合研發(fā)工作。本次報告中高揚博士公布了貝瑞基因與家輝醫(yī)院共同合作、在全國網(wǎng)絡(luò)化地推廣應(yīng)用NIPT的74萬多份隨訪統(tǒng)計結(jié)果，結(jié)果顯示貝瑞基因的NIPT檢測對三大染色體非整倍體的靈敏度和特異性均超過99%，對T21的的陽性預(yù)測值（PPV）高達(dá)95%。

在現(xiàn)有文獻(xiàn)報道基礎(chǔ)上，高揚博士指出，在產(chǎn)前檢測中，如僅對染色體數(shù)目和大片段的染色體結(jié)構(gòu)異常進(jìn)行檢測，將可能造成20%左右的染色體異常漏診。值得關(guān)注的是，隨著NIPT技術(shù)臨床應(yīng)用的不斷深入，介入性產(chǎn)前診斷數(shù)量呈逐漸減少的趨勢。

貝瑞基因與家輝醫(yī)院充分結(jié)合產(chǎn)前篩查的發(fā)展趨勢，通過加深測序深度、加強生物信息學(xué)算法的技術(shù)攻關(guān)，將無創(chuàng)的NIPT檢測范圍逐步擴(kuò)大至性染色體異常檢測以及常見的嚴(yán)重致病的染色體微重復(fù)微缺失綜合征的檢測。在對6萬多份臨床樣本進(jìn)行NIPT-Plus檢測的隨訪統(tǒng)計數(shù)據(jù)分析后發(fā)現(xiàn)，其中檢出最多的是22q11缺失綜合征，其他小于10Mb的致病性微重復(fù)微缺失也發(fā)現(xiàn)多例，這些異常是傳統(tǒng)核型與普通NIPT都難以檢出的。目前NIPT-Plus這項檢測能對100余種疾病在產(chǎn)前通過孕婦外周血進(jìn)行無創(chuàng)的篩查，可及早了解胎兒染色體微缺失微重復(fù)情況，為胎兒的健康提供更全面、更有效的保障。

隨后，高揚博士介紹了貝瑞基因與家輝醫(yī)院一同開發(fā)的無創(chuàng)單基因病檢測的技術(shù)策略，通過三代測序等技術(shù)平臺對孕婦外周血白細(xì)胞進(jìn)行檢測，對二代測序技術(shù)暫無法解決的單基因病攜帶者篩查，進(jìn)一步闡明所謂“一管血的價值”。

在談到“一管羊水的價值”時，高揚博士指出，根據(jù)產(chǎn)前診斷機(jī)構(gòu)臨床數(shù)據(jù)顯示，目前，NIPT作為一種常見的染色體數(shù)目異常產(chǎn)前篩查技術(shù)，檢測的特異性和準(zhǔn)確性高，這使得選擇介入性產(chǎn)前診斷的人群對后續(xù)檢測有較高的期望值。在這種情況下，需要一種無需細(xì)胞培養(yǎng)的穩(wěn)定、快速、通量大、精度高、成本低的檢測方法來實現(xiàn)對染色體微重復(fù)微缺失的準(zhǔn)確診斷，較傳統(tǒng)的G顯帶核型分析技術(shù)、芯片技術(shù)等介入性診斷技術(shù)，基于高通量測序的CNV-Seq技術(shù)，可以真正的提升“一管羊水的價值”。

通過多家臨床機(jī)構(gòu)臨床數(shù)據(jù)證實，CNV-Seq技術(shù)正是一種適用于羊水、臍血、絨毛、流產(chǎn)物、外周血等多種樣本，其分析效能優(yōu)于中密度的芯片。同時，高揚博士分享了來自172家產(chǎn)前診斷機(jī)構(gòu)的1萬多例產(chǎn)前診斷CNV-Seq檢測隨訪統(tǒng)計結(jié)果，通過這1萬多例臨床產(chǎn)前診斷樣本與核型分析的平行對比發(fā)現(xiàn)，CNV-Seq比核型分析多檢出289個明確致病的微重復(fù)微缺失綜合征胎兒；CNV-Seq幫助明確了47例核型分析不能明辨的產(chǎn)前診斷結(jié)果；還發(fā)現(xiàn)了3例非整倍體嵌合樣本。

高揚博士進(jìn)一步指出，對于CNV-Seq這項全基因組均勻掃描的檢測技術(shù)而言，難免會遇到與CMA一樣的問題——致病性未知變異（VOUS）的檢出。對于這些變異，高揚博士認(rèn)為，要通過貝瑞基因與各臨床機(jī)構(gòu)的共同努力，讓各機(jī)構(gòu)的臨床樣本的變異數(shù)據(jù)、胎兒表型數(shù)據(jù)變成真正的大數(shù)據(jù)，在不久的將來用來更好的解讀變異片段的致病性。

最后，高揚博士介紹了貝瑞基因正在研發(fā)測試的“分子核型”BioNano平臺，該平臺能直觀地對150Kb至1.5Mb的染色體片段進(jìn)行檢測，希望通過該平臺應(yīng)用的研發(fā)完善遺傳變異檢測的產(chǎn)品線，以期更好的實現(xiàn)出生缺陷基因防控技術(shù)體系的建設(shè)以及臨床應(yīng)用與推廣。