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新生兒血卡的全基因組微陣列分析(2)
新生兒采血卡在使用制造商的提取方法對(duì)存儲(chǔ)在經(jīng)處理的濾紙基質(zhì)如Whatman FTA或IsoCode上的干血斑的研究中獲得了類似的結(jié)果。在該研究中，在單次提取中獲得約25％的回收率，以每40uL成人血液輸入產(chǎn)生高達(dá)150ng的單鏈DNA作為200uL溶液。至于Sjoholm，由Mas等獲得的DNA。人?？梢杂行У赜糜诙嘀?/span>PCR和全基因組擴(kuò)增，但正如作者正確指出的那樣，可能過于稀釋也支持更復(fù)雜的研究，如全基因組微陣列分析。此外，由于Mas采用的DNA提取方法產(chǎn)生變性DNA，這種提取的產(chǎn)物不適用于諸如Affymetrix微陣列的方法，其需要在分析之前DNA底物保持天然的雙鏈狀態(tài)。
在這里，我們新生兒采血卡廠家描述了一種新技術(shù)的使用，稱為遺傳求解?，最初是作為一種高效方法開發(fā)的，用于從化學(xué)處理的FTA濾紙上的血斑中回收原生DNA ，但此處用于從新生兒血液中回收DNA作為各省出生缺陷監(jiān)測(cè)計(jì)劃的一部分，從1991年到2003年收集的標(biāo)準(zhǔn)Guthrie卡上的斑點(diǎn)。遺傳求解技術(shù)與標(biāo)準(zhǔn)DNA純化結(jié)合使用，然后在Illumina 610珠陣列微陣列平臺(tái)上進(jìn)行分析，該平臺(tái)可并行查詢約61萬個(gè)人SNP變異位點(diǎn)。
盡管Illumina 610芯片不包含專為新生兒篩查開發(fā)的內(nèi)容，但Illumina 610芯片上進(jìn)行的分析規(guī)?？梢暈槿魏未笮腿蚪MSNP測(cè)試的技術(shù)替代品，可以開發(fā)為篩選工具。在不久的將來，新生兒篩查可能會(huì)繼續(xù)采用串聯(lián)質(zhì)譜和相關(guān)方法介導(dǎo)的生化分析，并行地進(jìn)行基因檢測(cè)。通常，只有一小部分干燥的新生兒樣品可用于微陣列或微陣列樣遺傳分析。因此，這里描述的工作集中在使用從兩個(gè)3毫米直徑的Guthrie卡片中獲得的DNA的微陣列測(cè)試，大約是新生兒通常采集的血液的1/40，在標(biāo)準(zhǔn)的5點(diǎn)Whatman 903 Guthrie卡上。
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